Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALYREFQ86V81 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALYREFQ86V81 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms