Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC6BQ86SZ2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC6BQ86SZ2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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