Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NPM2Q86SE8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NPM2Q86SE8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms