Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RD3Q7Z3Z2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms