Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APTXQ7Z2E3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APTXQ7Z2E3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms