Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTOP2Q7RTS6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTOP2Q7RTS6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTOP2Q7RTS6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms