Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBR3Q6ZT12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms