Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SHISA6Q6ZSJ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SHISA6Q6ZSJ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms