Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFXL1Q6ZNB6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
NFXL1Q6ZNB6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFXL1Q6ZNB6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms