Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTR9Q6PD62 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTR9Q6PD62 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTR9Q6PD62 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms