Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF6Q6KF10 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF6Q6KF10 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF6Q6KF10 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms