Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ANKRD40Q6AI12 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ANKRD40Q6AI12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ANKRD40Q6AI12 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms