Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TNS3Q68CZ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TNS3Q68CZ2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TNS3Q68CZ2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms