Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARP1BQ659C4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP1BQ659C4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms