Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USPL1Q5W0Q7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USPL1Q5W0Q7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms