Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFMBT2Q5VUG0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFMBT2Q5VUG0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms