Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC3Q5JS37 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms