Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM61Q5EBN2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM61Q5EBN2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms