Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF542PQ5EBM4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF542PQ5EBM4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF542PQ5EBM4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms