Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZC3H12AQ5D1E8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZC3H12AQ5D1E8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms