Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF6Q58WW2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF6Q58WW2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms