Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RFTN2Q52LD8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN2Q52LD8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms