Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTXN3Q4LDR2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTXN3Q4LDR2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms