Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFAF6Q330K2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFAF6Q330K2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms