Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMPG1Q17R60 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMPG1Q17R60 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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