Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PFKFB3Q16875 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFKFB3Q16875 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFKFB3Q16875 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
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