Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCSK7Q16549 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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PCSK7Q16549 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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PCSK7Q16549 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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PCSK7Q16549 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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PCSK7Q16549 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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PCSK7Q16549 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCSK7Q16549 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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