Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ETFDHQ16134 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms