Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TCEA2Q15560 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCEA2Q15560 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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