Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHHQ15465 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHHQ15465 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHHQ15465 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHHQ15465 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHHQ15465 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHHQ15465 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHHQ15465 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHHQ15465 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHHQ15465 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHHQ15465 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHHQ15465 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHHQ15465 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHHQ15465 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHHQ15465 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHHQ15465 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHHQ15465 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHHQ15465 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHHQ15465 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHHQ15465 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHHQ15465 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHHQ15465 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHHQ15465 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHHQ15465 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHHQ15465 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHHQ15465 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHHQ15465 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHHQ15465 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHHQ15465 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHHQ15465 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHHQ15465 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHHQ15465 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHHQ15465 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SHHQ15465 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SHHQ15465 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHHQ15465 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHHQ15465 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHHQ15465 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHHQ15465 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHHQ15465 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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