Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CNN3Q15417 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNN3Q15417 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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