Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLD3Q15054 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD3Q15054 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms