Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GAPVD1Q14C86 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
GAPVD1Q14C86 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GAPVD1Q14C86 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
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