Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFTN1Q14699 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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