Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRF5Q13568 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRF5Q13568 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRF5Q13568 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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