Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HDAC1Q13547 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDAC1Q13547 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
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