Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLN3Q13286 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLN3Q13286 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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