Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TP53BP1Q12888 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TP53BP1Q12888 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms