Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COX10Q12887 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COX10Q12887 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COX10Q12887 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COX10Q12887 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COX10Q12887 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COX10Q12887 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms