Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 PUF2YPR042C 3228 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 KCC4YCL024W 3114 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 CTK1YKL139W 1587 nt4.31□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 EXO70YJL085W 1872 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RAD52YML032C 1416 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YHR202WYHR202W 1809 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YCR050CYCR050C 309 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YDR042CYDR042C 603 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 CNL1YDR357C 369 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RPN9YDR427W 1182 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 ARC15YIL062C 465 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RCN1YKL159C 636 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YLL037WYLL037W 381 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 CDC42YLR229C 576 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 TRI1YMR233W 681 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RPC34YNR003C 954 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YNR025CYNR025C 360 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 TYE7YOR344C 876 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 POP4YBR257W 840 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 MIC60YKR016W 1623 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 ECM32YER176W 3366 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 ALG2YGL065C 1512 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 NUP2YLR335W 2163 nt4.3□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 GAT2YMR136W 1683 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 FZO1YBR179C 2568 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 SPC105YGL093W 2754 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 SNU23YDL098C 585 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YDL124WYDL124W 939 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RPL35BYDL136W 363 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 MEI4YER044C-A 1227 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 STE2YFL026W 1296 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tQ(UUG)CtQ(UUG)C 72 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tQ(UUG)D1tQ(UUG)D1 72 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tQ(UUG)D2tQ(UUG)D2 72 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tQ(UUG)D3tQ(UUG)D3 72 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tQ(UUG)E1tQ(UUG)E1 72 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tQ(UUG)HtQ(UUG)H 72 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 tQ(UUG)LtQ(UUG)L 72 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YKE4YIL023C 1041 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 FIP1YJR093C 984 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YKL091CYKL091C 933 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 ARC40YBR234C 1155 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 MET4YNL103W 2019 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RCM1YNL022C 1473 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 TFA1YKL028W 1449 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 IOC4YMR044W 1428 nt4.29□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 ENT1YDL161W 1365 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 IRC22YEL001C 678 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 PFS1YHR185C 714 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 RAD27YKL113C 1149 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 DCS1YLR270W 1053 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YML047W-AYML047W-A 366 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 MRPL3YMR024W 1173 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 SUA7YPR086W 1038 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YBR116CYBR116C 528 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 STP4YDL048C 1473 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 YNR065CYNR065C 3351 nt4.28□□□□□ -1.72
LCB4Q12246 NUF2YOL069W 1356 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 YIG1YPL201C 1386 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 YPL260WYPL260W 1656 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 YGL117WYGL117W 798 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 BUD13YGL174W 801 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 SUB1YMR039C 879 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 RNA1YMR235C 1224 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 YPL068CYPL068C 882 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 MCM2YBL023C 2607 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 VBA2YBR293W 1425 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 SAG1YJR004C 1953 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 PEP5YMR231W 3090 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 SSU1YPL092W 1377 nt4.27□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 PST1YDR055W 1335 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 SUP45YBR143C 1314 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 GZF3YJL110C 1656 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 YEL010WYEL010W 351 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 YGL204CYGL204C 306 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 LST7YGR057C 729 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 NBP1YLR457C 960 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 FAR3YMR052W 615 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 ATG8YBL078C 354 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 snR11snR11 258 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 HPR1YDR138W 2259 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 SPT14YPL175W 1359 nt4.26□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 PDR12YPL058C 4536 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 PMT4YJR143C 2289 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 YNR066CYNR066C 1311 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 FRE1YLR214W 2061 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 COX6YHR051W 447 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 GVP36YIL041W 981 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 CDC8YJR057W 651 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 IMP2YMR035W 534 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 YNL320WYNL320W 855 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 RFM1YOR279C 933 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 DSS4YPR017C 432 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 TYW1YPL207W 2433 nt4.25□□□□□ -1.73
LCB4Q12246 HAP4YKL109W 1665 nt4.25□□□□□ -1.73
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