Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YJR096WYJR096W 849 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 MRP8YKL142W 660 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 FMP46YKR049C 402 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 ECM16YMR128W 3804 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 PHM7YOL084W 2976 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 VPS69YPR087W 321 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 CTR1YPR124W 1221 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 snR34snR34 203 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YEH2YLR020C 1617 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 CUE3YGL110C 1875 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YMR018WYMR018W 1545 nt3.9□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 ZDS2YML109W 2829 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 MTR4YJL050W 3222 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 FLO9YAL063C 3969 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 NUP159YIL115C 4383 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YDR222WYDR222W 1248 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 STE14YDR410C 720 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YDR431WYDR431W 312 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 RPS18AYDR450W 441 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 WBP1YEL002C 1293 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 VFA1YER128W 612 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 RPL14AYKL006W 417 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 VPS68YOL129W 555 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 CEG1YGL130W 1380 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 CLG1YGL215W 1359 nt3.89□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 PRM15YMR278W 1869 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 SQS1YNL224C 2304 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 SHU2YDR078C 672 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YFL065CYFL065C 309 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YAL004WYAL004W 648 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 CCS1YMR038C 750 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YNL296WYNL296W 315 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 SIL1YOL031C 1266 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 RRP40YOL142W 723 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YPL088WYPL088W 1029 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 FDH2YPL275W 711 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YBR242WYBR242W 717 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 MRPL37YBR268W 318 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 ALA1YOR335C 2877 nt3.88□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 SLM2YNL047C 1971 nt3.87□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 GPI1YGR216C 1830 nt3.87□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 SPT6YGR116W 4356 nt3.87□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 SAY1YGR263C 1275 nt3.87□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 RPC17YJL011C 486 nt3.87□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 GLO4YOR040W 858 nt3.87□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YPL278CYPL278C 303 nt3.87□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 HAP4YKL109W 1665 nt3.87□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YLR177WYLR177W 1887 nt3.86□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 PTC1YDL006W 846 nt3.86□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 TRP4YDR354W 1143 nt3.86□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YGR026WYGR026W 837 nt3.86□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 SIW14YNL032W 846 nt3.86□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 LDS2YOL047C 1071 nt3.86□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 RFM1YOR279C 933 nt3.86□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 UAF30YOR295W 687 nt3.86□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YOR338WYOR338W 1092 nt3.86□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 RSM23YGL129C 1353 nt3.86□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 DPH6YLR143W 2058 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 DSN1YIR010W 1731 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 snR63snR63 255 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 BSC2YDR275W 708 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 EDC1YGL222C 528 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 EFB1YAL003W 621 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YJL220WYJL220W 453 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 HRT3YLR097C 1035 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YBL094CYBL094C 333 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 NDJ1YOL104C 1059 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YOR314WYOR314W 330 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 MET16YPR167C 786 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 HPA2YPR193C 471 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 EFM2YBR271W 1260 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 AEP3YPL005W 1821 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YGR117CYGR117C 1431 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 CHD1YER164W 4407 nt3.85□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 GDH2YDL215C 3279 nt3.84□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 RPC53YDL150W 1269 nt3.84□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YOS1YER074W-A 258 nt3.84□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YIR014WYIR014W 729 nt3.84□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 MCM1YMR043W 861 nt3.84□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 YOR379CYOR379C 339 nt3.84□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 FES1YBR101C 873 nt3.84□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 PST1YDR055W 1335 nt3.84□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 BUD27YFL023W 2391 nt3.84□□□□□ -1.79
NFI1Q12216 TRE2YOR256C 2430 nt3.84□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 RPO31YOR116C 4383 nt3.84□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 GRX3YDR098C 858 nt3.83□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt3.83□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 SHE1YBL031W 1017 nt3.83□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 ASC1YMR116C 960 nt3.83□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 MRPS17YMR188C 714 nt3.83□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 APN2YBL019W 1563 nt3.83□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 BAR1YIL015W 1764 nt3.83□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 FAS2YPL231W 5664 nt3.83□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 PFK26YIL107C 2484 nt3.83□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 RPN2YIL075C 2838 nt3.83□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 BMS1YPL217C 3552 nt3.82□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 AZR1YGR224W 1842 nt3.82□□□□□ -1.8
NFI1Q12216 LYP1YNL268W 1836 nt3.82□□□□□ -1.8
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