Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNA1Q09470 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNA1Q09470 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms