Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD300CQ08708 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CD300CQ08708 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms