Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 SMP3YOR149C 1551 nt2.95□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 PUF2YPR042C 3228 nt2.95□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 HDA2YDR295C 2025 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 FCF1YDR339C 570 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 RPS0AYGR214W 759 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 YGR291CYGR291C 222 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 YAL004WYAL004W 648 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 RUF21RUF21 707 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 SAS5YOR213C 747 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 PGS1YCL004W 1566 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 RAD5YLR032W 3510 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 SNQ2YDR011W 4506 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 MAK21YDR060W 3078 nt2.94□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 IOC3YFR013W 2364 nt2.93□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 FAP7YDL166C 594 nt2.93□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.93□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 COS12YGL263W 1143 nt2.93□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 YHB1YGR234W 1200 nt2.93□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 BCD1YHR040W 1101 nt2.93□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 PRM9YAR031W 897 nt2.93□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 OST6YML019W 999 nt2.93□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 SPO71YDR104C 3738 nt2.93□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 POL2YNL262W 6669 nt2.93□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 ROM1YGR070W 3468 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 RPN1YHR027C 2982 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 NAM9YNL137C 1461 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 ENT5YDR153C 1236 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 RPA14YDR156W 414 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 TYS1YGR185C 1185 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 YLR124WYLR124W 345 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 YPL014WYPL014W 1146 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 RPL19AYBR084C-A 570 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 RIB5YBR256C 717 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 MUP3YHL036W 1641 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 RTT109YLL002W 1311 nt2.92□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 FAR1YJL157C 2493 nt2.91□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 CWC2YDL209C 1020 nt2.91□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 TOM20YGR082W 552 nt2.91□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 LSM1YJL124C 519 nt2.91□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 ENT3YJR125C 1227 nt2.91□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 UPS2YLR168C 693 nt2.91□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 UNG1YML021C 1080 nt2.91□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 RAD2YGR258C 3096 nt2.91□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 FKH2YNL068C 2589 nt2.91□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 UBP12YJL197W 3765 nt2.9□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 PRP31YGR091W 1485 nt2.9□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 SKN7YHR206W 1869 nt2.9□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 VPS27YNR006W 1869 nt2.9□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 AUS1YOR011W 4185 nt2.9□□□□□ -1.94
HRD1Q08109 YDL071CYDL071C 375 nt2.9□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 HTA2YBL003C 399 nt2.9□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 RHO5YNL180C 996 nt2.9□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 BUD6YLR319C 2367 nt2.9□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 THR4YCR053W 1545 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YDR149CYDR149C 708 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 ERJ5YFR041C 888 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 DSD1YGL196W 1287 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 FOL2YGR267C 732 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 RRM3YHR031C 2172 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 VPS53YJL029C 2469 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 SMC3YJL074C 3693 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YKL091CYKL091C 933 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 VTA1YLR181C 993 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 IZH2YOL002C 954 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YOR238WYOR238W 912 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 RIF1YBR275C 5751 nt2.89□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 ALG1YBR110W 1350 nt2.88□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 MAF1YDR005C 1188 nt2.88□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YKE4YIL023C 1041 nt2.88□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YIR043CYIR043C 693 nt2.88□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 DAN1YJR150C 897 nt2.88□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 RIB4YOL143C 510 nt2.88□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 BCH1YMR237W 2175 nt2.88□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 KAP104YBR017C 2757 nt2.88□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 GPI13YLL031C 3054 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 MIX14YDR031W 366 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 INO2YDR123C 915 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 BET1YIL004C 429 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YVH1YIR026C 1095 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 MRPL20YKR085C 588 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YAL065CYAL065C 387 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 CPR8YNR028W 927 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 TIP41YPR040W 1071 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 GCN1YGL195W 8019 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 MSR1YHR091C 1932 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 RPN6YDL097C 1305 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 DXO1YDR370C 1329 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 KTR6YPL053C 1341 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 ARG5,6YER069W 2592 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 GYP6YJL044C 1377 nt2.87□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 ARH1YDR376W 1482 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YCL075WYCL075W 441 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 PSF1YDR013W 627 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 PEX10YDR265W 1014 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YDR442WYDR442W 393 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 OKP1YGR179C 1221 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 IMP1YMR150C 573 nt2.86□□□□□ -1.95
HRD1Q08109 YOR338WYOR338W 1092 nt2.86□□□□□ -1.95
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