Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DEUP1Q05D60 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEUP1Q05D60 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms