Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIN1Q05586 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN1Q05586 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms