Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 GPB1YOR371C 2694 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 TSL1YML100W 3297 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 PER1YCR044C 1074 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YDL027CYDL027C 1263 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YGR115CYGR115C 780 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 VPS29YHR012W 849 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YHR173CYHR173C 339 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 MMF1YIL051C 438 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 MRPL39YML009C 213 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YML047W-AYML047W-A 366 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 FMP41YNL168C 780 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 SGT1YOR057W 1188 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 BUD21YOR078W 645 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 CUP9YPL177C 921 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 DNF2YDR093W 4839 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 CYM1YDR430C 2970 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 VPS38YLR360W 1320 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 MDR1YGR100W 2853 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 PEP5YMR231W 3090 nt5.17□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt5.16□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 WRS1YOL097C 1299 nt5.16□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 TRS20YBR254C 528 nt5.16□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 UBA2YDR390C 1911 nt5.16□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 OLE1YGL055W 1533 nt5.16□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 TAF8YML114C 1533 nt5.16□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 IMD2YHR216W 1572 nt5.16□□□□□ -1.58
HRQ1Q05549 YCL068CYCL068C 783 nt5.15□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 ARF2YDL137W 546 nt5.15□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YGR064WYGR064W 369 nt5.15□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YJL028WYJL028W 336 nt5.15□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YOR238WYOR238W 912 nt5.15□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YBR071WYBR071W 636 nt5.15□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 NTH2YBR001C 2343 nt5.15□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 SLI1YGR212W 1407 nt5.14□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YCR108CYCR108C 192 nt5.14□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 GRX3YDR098C 858 nt5.14□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt5.14□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YGL138CYGL138C 1038 nt5.14□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 FOL2YGR267C 732 nt5.14□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 SWD2YKL018W 990 nt5.14□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 GAL7YBR018C 1101 nt5.14□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YGL176CYGL176C 1665 nt5.14□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 BCS1YDR375C 1371 nt5.14□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 RCM1YNL022C 1473 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 GZF3YJL110C 1656 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 RRP45YDR280W 918 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 MTC7YEL033W 420 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 GLE2YER107C 1098 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 RPL24AYGL031C 468 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 CAP2YIL034C 864 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 ARC15YIL062C 465 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 LSO1YJR005C-A 282 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 AUR1YKL004W 1206 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YMR010WYMR010W 1218 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 DLT1YMR126C 1029 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 MPP6YNR024W 561 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 MRPL27YBR282W 441 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 HOYDL227C 1761 nt5.13□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 CTK1YKL139W 1587 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YGL109WYGL109W 324 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 FRA2YGL220W 363 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 GCD14YJL125C 1152 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 MAP1YLR244C 1164 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 HLJ1YMR161W 675 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YBL059WYBL059W 582 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 SPR2YOR214C 711 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 MAG2YLR427W 2013 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 ENT1YDL161W 1365 nt5.12□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 GAD1YMR250W 1758 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 snR7-SsnR7-S 179 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 SPR28YDR218C 1272 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 LSM4YER112W 564 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 PGD1YGL025C 1194 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YGL242CYGL242C 546 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 THP2YHR167W 786 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 IKI1YHR187W 930 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YLR217WYLR217W 324 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 TOM7YNL070W 183 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 NIS1YNL078W 1224 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YNR042WYNR042W 429 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 MIX23YBL107C 591 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 CKA2YOR061W 1020 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 RRG7YOR305W 729 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 OXR1YPL196W 822 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 POP7YBR167C 423 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 REI1YBR267W 1182 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 PCI8YIL071C 1335 nt5.11□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 VHC1YBR235W 3363 nt5.1□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YCR101CYCR101C 549 nt5.1□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YAP6YDR259C 1152 nt5.1□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 ZRT1YGL255W 1131 nt5.1□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 CAB4YGR277C 918 nt5.1□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt5.1□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 IOC4YMR044W 1428 nt5.1□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YMR187CYMR187C 1296 nt5.1□□□□□ -1.59
HRQ1Q05549 YOR366WYOR366W 354 nt5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms