Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTK2Q05397 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTK2Q05397 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTK2Q05397 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms