Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3AQ05086 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3AQ05086 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms