Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPL6Q02878 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPL6Q02878 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms